Để cải thiện tình trạng ô nhiễm và khôi phục dòng chảy của sông, các biện pháp cải tạo đã được UBND TP Hà Nội gấp rút triển khai trong nhiều năm qua. Mới đây, Hà Nội cũng thực hiện các dự án bổ cập nước từ sông Hồng và xây dựng đập dâng tại các vị trí như cầu Quang (xã Thanh Liệt, huyện Thanh Trì), cầu Dậu (Linh Đàm, quận Hoàng Mai) và cầu Cót (phường Yên Hòa, quận Cầu Giấy) nhằm điều chỉnh mực nước, cải thiện chất lượng nước và tạo cảnh quan hai bên bờ sông.